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近日,《第一期全国病原体高通量测序临床规范化应用培训研讨班》在湖南长沙隆重召开。多位专家从病原NGS检测技术路线、指南共识解读、实验室质量控制等方面进行分享和培训,来自全国病原检测领域的300多名医生代表、检测从业者参加。会上,吉因加tNGS血流感染病原体检测技术受到了参会者的广泛关注。
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作为聚焦tNGS技术的检测公司,吉因加在tNGS领域取得了一系列研究成果和进展,在会议相关分享中,吉因加病原研发总监杨振宇博士就《基于tNGS的血流感染病原体检测流程的建立与质量保证》作主题汇报,从临床需求与预期用途、tNGS方法学建立及其关键环节的优化、分析性能评价、SOPs的建立和质量保证四个方面做了全面阐述。对技术策略选择,快杂、防污染监控、比对算法等关键技术方法建立进行了重点分析,另对建立质量管理体系,提供体系化SOP,为在院端实验室落地提供支持。
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& V8 I" T: X; `. {# L01为何选择探针捕获法技术
6 V& S7 g8 B( k* C/ U* C相对多重引物扩增法,对于血浆游离DNA,片段化严重,靶标序列多样,载量低的特征,探针捕获法可对靶区域覆盖更全面、且不受引物二聚体影响,脱靶率低,在血液样本检测性能上更有保障。
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: j1 r9 r' q4 S02流程复杂与时效性的矛盾怎样化解6 x0 R- w4 J( S: }6 @7 j
捕获tNGS实验流程是在mNGS基础上增加探针杂交捕获步骤,通过自主合成平台,使用自研1h快速杂交技术,实现“设计+合成+应用”的原研探针,保障试剂盒捕获性能,解决过夜杂交带来的时效性问题,实现20h交付。* j1 l( f4 E3 h$ ^' b' T
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03探针捕获技术比对分析的优势
1 \2 c* q6 O {一个好的目标区域富集检测,片段的多样性越高,表明越接近真实。而在建库过程中PCR引入的重复片段,不代表真实的靶区域富集。tNGS比对应重点考虑去重后的Reads。相较于多重tNGS,探针捕获tNGS靶区域更多、片段多样性更高,可以实现多靶区域同时富集、相互印证,从而提高比对序列的特异性和整体检测的灵敏度。 }" m: _) ^* J$ b" B
4 w( @: |2 z5 @9 q% G04强阳样本带来的气溶胶污染监控
/ m/ V0 N) a* i: J通过在提取环节加入样本特异性内参进行全流程监控,可识别低至十万分之一的污染率,并结合污染样本间病原reads比例及分布的分析对假阳性病原进行识别,达到强阳样本污染识别和剔除目的。
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9 o' z' j; \4 ?7 {会中,吉因加制造副总裁楚玉星及IVD研发总监易玉婷也分别就多重引物扩增法与捕获探针法的技术比较,对吉因加为什么选择探针捕获方法进行产品开发及在耐药检测方面的应用做了相关阐述。吉因加对于产品开发和技术探索的认真与专业的态度、对自身tNGS技术产品的打磨锤炼,以及对整个行业发展的积极推动,获得了在场多位专家的肯定与认可。
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3 C: P4 C% m+ L% ~5 i+ I再定义tNGS5 o4 g$ z$ Y, Z6 }* V
吉因加tNGS-Max兼具广度、深度和精度
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吉因加tNGS-Max靶向病原检测,结合探针杂交捕获与二代测序技术,基于吉因加自主合成平台和自研1h快杂技术,从检测广度、深度和精度三个维度,实现临床99%的病原覆盖、低载量病原稳定检出和耐药位点精确识别,全面满足血流感染、呼吸系统感染、中枢神经系统感染症候群的临床检测需求。% }& L9 J8 h9 O/ A7 o5 @
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0 G5 v, C( v- V* \* N3 ^+ |& b" w吉因加tNGS全流程整体解决方案,助力病原检测院内真落地。捕获tNGS实验流程增加了探针杂交捕获步骤,通过采用1h快速杂交技术代替过夜杂交,搭载自动化工作站,国产化测序平台、分析解读一体机,实现全流程20h交付。
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关于吉因加* N2 Y0 x" O( E* t$ h: S
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吉因加创立于2015年,是诞生于精准医疗大背景下的创新型高科技企业。公司坚持国产自主战略,以检测大平台、制造大平台和数据大平台为载体,提供面向医学、科技、健康三大业务方向的基因检测产品与服务,实现从技术突破、学术引领、产品创新到市场领先的发展之路。+ I2 F2 a- C3 N8 ]7 O+ b
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